การวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมและการจำแนกขมิ้นด้วยเทคนิคแฮตอาร์เอพีดี

Abstract

บทคัดย่อ

การศึกษาความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของขมิ้น 6 ชนิด จำนวน 10 ตัวอย่าง ด้วยเทคนิคแฮตอาร์เอพีดีโดยใช้ไพรเมอร์แบบสุ่ม 72 สาย พบว่าไพรเมอร์ 35 สาย สามารถเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอได้ เมื่อคัดเลือกไพรเมอร์ 20 สาย ที่ให้ลายพิมพ์ดีเอ็นเออย่างชัดเจนมาวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรม พบว่าสามารถแยกความแตกต่างระหว่างพันธุ์ได้ด้วยแถบดีเอ็นเอที่จำเพาะกับตัวอย่าง นอกจากนั้นยังพบไพรเมอร์ที่สามารถจำแนกขมิ้นทั้ง 10  ตัวอย่าง ได้ด้วยไพรเมอร์เพียงไพรเมอร์เดียว เมื่อวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมพบว่าสามารถจำแนกขมิ้นทั้ง 10 ตัวอย่าง เป็น 4 กลุ่ม โดยมีค่าสัมประสิทธิ์ความเหมือนอยู่ระหว่าง 0.38 ถึง 0.83

คำสำคัญ :

ขมิ้น; การจำแนกพันธุ์; ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรม; แฮตอาร์เอพีดี

Abstract

High annealing temperature random amplified polymorphic DNA (HAT-RAPD) technique was used to study the genetic relationship among 10 samples of 6 Curcuma species. Thirty-five random primers out of seventy-two were successful for DNA amplification. In this study, we selected 20 random primers which gave clear amplified products for genetic analysis. The result showed significant differences among 6 species and also showed bands in each sample. Moreover, we found 10 random primers which tended to be DNA markers for Curcuma identification. A dendrogram constructed based on polymorphic bands showed genetic similarities among 6 Curcuma species and were separated into 4 clusters with similarity coefficients ranging from 0.38 to 0.83.

Keywords:

Curcuma; identification; genetic relationship; HAT-RAPD