การประเมินความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมและการระบุชนิดของกล้วยไม้สกุลเอื้องเทียนด้วยลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีน rpoC1 และชิ้นดีเอ็นเอที่อยู่ระหว่างยีน trnH กับ psbA
Article Sidebar
Main Article Content
Abstract
บทคัดย่อ
กล้วยไม้สกุลเอื้องเทียนเป็นกล้วยไม้อิงอาศัย จัดอยู่ในวงศ์ Orchidaceae เป็นกล้วยไม้ที่มีดอกสวยงามและมีกลิ่นหอม ปัจจุบันการจำแนกชนิดของกล้วยไม้ด้วยลักษณะสัณฐานทำได้ยากและมีความผิดพลาดสูง ดังนั้นงานวิจัยนี้จึงใช้ลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีน rpoC1 และชิ้นดีเอ็นเอที่อยู่ระหว่างยีน trnH กับ psbA เพื่อระบุชนิดและประเมินความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของกล้วยไม้สกุลเอื้องเทียน 24 ชนิด โดยการเพิ่มปริมาณชิ้นดีเอ็นเอของ rpoC1 และ trnH-psbA ด้วยปฏิกิริยาลูกโซ่พอลิเมอเรส แล้วนำไปตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงของลำดับนิวคลีโอไทด์ด้วยโปรแกรม ClustalW และสร้างแผนภูมิความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมด้วยโปรแกรม MEGA 7.0 ผลการศึกษาพบว่าลำดับนิวคลีโอไทด์ของ rpoC1 และ trnH-psbA สามารถระบุชนิดของเอื้องเทียนได้ 7 และ 15 ชนิด ตามลำดับ เมื่อวิเคราะห์ข้อมูลลำดับนิวคลีโอไทด์ทั้ง 2 บริเวณ ร่วมกัน พบว่าสามารถจำแนกเอื้องเทียนได้เกือบทุกชนิด ยกเว้นเอื้องเทียนลำเขียวและเอื้องลำเทียนปากดำ
คำสำคัญ : กล้วยไม้; สกุลเอื้องเทียน; ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรม; ยีน rpoC1; ชิ้นดีเอ็นเอที่อยู่ระหว่างยีน trnH-psbA
Abstract
The Coelogyne is a sympodial epiphytes from the family Orchidaceae. The plants have beautiful and fragrant flowers. Currently, identification of orchid species based on morphology is difficult and high error. This research, the nucleotide sequences of specific sites were used to identify 24 samples of Coelogyne. Polymerase chain reaction (PCR) was used to amplify rpoC1 gene and trnH-psbA intergenic spacer. The PCR products of rpoC1 gene and trnH-psbA intergenic spacer were sequenced and then the data were analyzed by ClustalW and MEGA 7.0. The results showed that nucleotide sequences of rpoC1 gene and trnH-psbA intergenic spacer could distinguish 7 and 15 out of 24 orchids, respectively. The combined nucleotide sequences of rpoC1 gene and trnH-psbA intergenic spacer were capable to identify most of Coelogyne, excepted C. lentiginosa and C. brachyptera.
Keywords: orchid; Coelogyne; genetic relationship; rpoC1 gene; trnH-psbA intergenic spacer
Article Details
บทความที่ได้รับการตีพิมพ์เป็นลิขสิทธิ์ของคณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี มหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์ ข้อความที่ปรากฏในแต่ละเรื่องของวารสารเล่มนี้เป็นเพียงความเห็นส่วนตัวของผู้เขียน ไม่มีความเกี่ยวข้องกับคณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี หรือคณาจารย์ท่านอื่นในมหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์ ผู้เขียนต้องยืนยันว่าความรับผิดชอบต่อทุกข้อความที่นำเสนอไว้ในบทความของตน หากมีข้อผิดพลาดหรือความไม่ถูกต้องใด ๆ